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基于预训练二级结构模型和结构感知注意力的RNA三维结构及构象体预测
AI 摘要
trRosettaRNA2是一种端到端深度学习方法,用于预测RNA三维结构及其构象体。它整合了在大量二级结构数据上预训练的模块,以提供碱基配对先验,该模块本身也是性能领先的RNA二级结构预测工具trRNA2-SS。通过结构感知注意力机制,该方法能生成RNA三维结构和构象体。基准测试表明,尽管参数和计算资源更少,其性能仍优于其他方法。在CASP16盲测中,基于该方法的Yang-Server成为顶级自动化服务器,超越了AlphaFold 3。应用显示,trRosettaRNA2能捕捉RNA结构异质性,展现预测构象集合的潜力。
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