软件工厂模式失败的核心原因在于过度依赖工程化流程，而忽视了软件开发的创造性、协作性和不确定性。文章指出，将软件开发简化为流水线式的重复劳动，会扼杀工程师的自主性和问题解决能力，导致效率不升反降。成功的软件交付需要平衡工程规范与人的能动性，而非单纯追求流程标准化。